Aufbau
- Allgemeine Statistik, Verteilungen und Bayessche Statistik (Brors)
- Analyse von Sequenzinformation (Brors/König/Frank)
- Multivariate Statistik, Entscheidungstheorie (König/Schubert)
- Bioinformatische Methoden in der Genomik(König/Schubert/Bulashevska)
Folien/Skripte
- Skript zum Teil 1 (verfügbar ab Mitte Nov.)
- Sequenzanalyse: Häufigkeitsverteilungen und statistische Modelle Folien
- Sequenzanalyse: evolutionäre Distanzschätzung Folien
- Sequenzalignment_1 (König) Folien (pdf!)
- Sequenzalignment_2 (König) Folien (pdf!)
- zu Sequenzalignment_3: Extremwertverteilung (König) Folien
Handgeschriebene Overhead-Folien zu Dayhoffmatrizen können bei mir zum Kopieren ausgeliehen werden- Genvorhersage (Bulashevska) Folien 1 Folien 2
- Hidden Markov Models (C del Val) HMM3_biotechnology.ppt
- RNA-Sekundärstrukturvorhersage (B.Brors)
- Klassifikation 1 (Schubert) Folien (pdf)
- Klassifikation 2 (Schubert) Folien (pdf)
- Klassifikation 3 (Schubert) Folien (pdf)
- Klassifikation 4 (Schubert) Folien (pdf)
- Klassifikation 5 (Schubert) Folien (pdf)
- Klassifikation 6 (Schubert) Folien (pdf)
- Neuronale Netze (Bulashevska S.) Folien (ppt)
Klausur
Gruppe A
Gruppe B
Übungen
Übungsblatt1 (Abgabe bis 21.10., 10 Uhr in INF 580*) Übungsblatt2 (Abgabe bis 27.10., 17 Uhr in INF 580*) Übungsblatt3 (Abgabe bis 03.11., 17 Uhr in INF 580*) Übungsblatt4 (Abgabe bis 14.11., 16.30 Uhr in INF 580*) Übungsblatt5 (Abgabe bis 21.11., 16.30 Uhr in INF 580*) Übungsblatt6, Aufgabe 1 (Abgabe bis 28.11., 16.30 Uhr in INF 580*) Übungsblatt6, Aufgabe 2 (Abgabe bis 28.11., 16.30 Uhr in INF 580*) Übungsblatt7 (Abgabe bis 5.12., 16.30 Uhr in INF 580*) Übungsblatt 8 (Abgabe bis 12.12., 16.30 Uhr in INF 580*) Übungsblatt 9 (Abgabe bis 9.1.04, 16.30 Uhr in INF 580*) Übungsblatt 10 (Abgabe bis 30.1.04, 16.30 Uhr in INF 580*) Übungsblatt 11 (Abgabe bis 6.2.04, 16.30 Uhr in INF 580*) Ergebnisse der Übungszettel
Termine
Datum Inhalt Dozent Übungen 13.10. Mengenlehre, Einführung in die Wahrscheinlichkeitstheorie, Zufallsversuche Brors 17.10. bedingte Wahrscheinlichkeiten, Binomialverteilung, Zufallsvariable, Erwartungswert und Varianz Brors Übungsblatt1 20.10. gemeinsame Verteilung von 2 Zufallsvariablen, Kovarianz, Schäzung von Mittelwert und Varianz aus einer Stichprobe Brors 24.10. robuste Schätzer, Poisson-Approximation und Normal-Approximation der Binomialverteilung Brors Übungsblatt2 27.10. Eigenschaften der Normalverteilung, Zentraler Grenzwertsatz, Verteilungsdiagnostik Brors 31.10. Bayessche Statistik Brors Übungsblatt3 3.11. Häufigkeitsverteilungen auf Sequenzen, CpG-Regionen, Sequenzlogos Brors 7.11. Evolutionäre Distanzschätzung: Jukes-Cantor-, Kimura-Modell Brors Übungsblatt4 10.11. Sequenzalignment 1 König Übungsblatt5 14.11. Sequenzalignment 2 König 17.11. Sequenzalignment 3 König Übungsblatt6b 21.11. Genvorhersage A. Bulashevska Übungsblatt6a 24.11. Hidden-Markov-Modelle C. del Val 28.11. RNA Sekundärstrukturvorhersage Brors Übungsblatt7 1.12. Multivariate Statistik 1 Brors 5.12. Multivariate Statistik 2 König Übungsblatt 8 8.12. Multivariate Statistik 3/Klassifikation 1 König/Schubert 12.12. Klassifikation 2 Schubert 15.12. Klassifikation 3 Schubert Übungsblatt 9 19.12. Vorlesungsfrei 9.1. Klassifikation 4 Schubert 16.1. Keine Vorlesung 19.1. Klassifikation 5 Schubert 23.1. Klassifikation 6 Schubert Übungsblatt 10 26.1. Neuronale Netze 1 Bulashevska S. 30.1. Neuronale Netze 2 Bulashevska S. Übungsblatt 11 2.2. 6.2. Keine Vorlesung am: 19.12.-6.1. (Weihnachtsferien), 12.1.,16.1 (group retreat), 9.2.-13.2. (Klausur)
Dozenten
- Benedikt Brors, b.brors@dkfz.de
- Alla Bulashevska, a.bulashevska@dkfz.de
- Svetlana Bulashevska, s.bulashevska@dkfz.de
- Coral del Val, c.delval@dkfz.de
- Rainer König, r.koenig@dkfz.de
- Falk Schubert, f.schubert@dkfz.de
*Gebäude INF 580 befindet sich im Technologiepark, s. Karte.