Computermethoden in der Biotechnologie

Studiengang Molekulare Biotechnologie
Wintersemester 2003/2004
Dozenten: Dr. Rainer König, Dr. Benedikt Brors

Veranstaltungen:

• 16.10.03 Funktionelle Genomanalyse, König, Vorlesung Teil 1
  Skript
  
  
• 17.10.03 Funktionelle Genomanalyse, König, Vorlesung Teil 2
  Skript
  
  
• 23.10.03 Funktionelle Genomanalyse, König, Übungen Teil 1,
  im CIP-Pool der Mediziner, 8-11Uhr, INF324, Erdgeschoss
  Übungsblatt 1 zu R
  
  Testdaten:
  
  1. Signal(primRshort.tab)
  2. local background(primbgdRshort.tab)
  
  
• 24.10.03 Funktionelle Genomanalyse, König, Übungen Teil 2 ,
  im CIP-Pool der Mediziner, 9-13Uhr, INF324, Erdgeschoss
  Übungsblatt 2 zu R
  
  
• 30.10.03 Funktionelle Genomanalyse, König, Übungen Teil 3,
  im CIP-Pool der Mediziner, 8-11Uhr, INF324, Erdgeschoss
  Übungsblatt 3 zu R
  
  Dazu braucht man diese Daten zum Normalisieren:
  
  1. Signal(primR2.tab)
  2. local background(primbgdR2.tab)
  
  
• 31.10.03 Funktionelle Genomanalyse, König, Übungen Teil 4,
  im CIP-Pool der Mediziner, 9-13Uhr, INF324, Erdgeschoss
  Übungsblatt 4 (Clustern)
  
  und diese Daten zum Clustern:
  
  kleinetabelle.tab
  Versuchsbeschreibung dazu (näheres, siehe Khodursky et al. (2000), PNAS, 97,12171)
  
  
  
• 6.11.03 Funktionelle Genomanalyse, König, Vorlesung Teil 3
  Seminarraum 17, INF 328, 9-11 Uhr
  Skript
  
  
• 7.11.03 Biologische Sequenz-Datenbanken, Hotz-Wagenblatt,Vorlesung
  Seminarraum 17, INF 328, 10-12 Uhr
  
  
• 13.11.03 Funktionelle Genomanalyse, König, Übungen Teil 5,
  im CIP-Pool der Mediziner, 8-11Uhr, INF324, Erdgeschoss
  Uebungsblatt zum Klassifizieren (fertig)
  Trainingsdaten
  Unbekannt
  
  
• 14.11.03 Funktionelle Genomanalyse, König, Übungen Teil 6,
  im CIP-Pool der Mediziner, 9-13Uhr, INF324, Erdgeschoss
  Übungsblatt vom 13.11.03
  
  
• 20.11.03 - 23.1.04 siehe Benedikt Brors:
  Webseite
  
  
• 29.1.04 Optimierung, König, Vorlesung 1
  Seminarraum 17, INF 328, 9-11 Uhr
  Skript
  
  
• 30.1.04 Optimierung, König, Vorlesung 2
  Seminarraum 17, INF 328, 10-12 Uhr
  
  
• 5.2.04 Optimierung, König, Übungen Teil 1,
  im CIP-Pool der Mediziner, 9-13 Uhr, INF 324, Erdgeschoss
  Uebungsblatt 1 zur Optimierung
  
  
• 6.2.04 Optimierung, König, Übungen Teil 2,
  im CIP-Pool der Mediziner, 9-13 Uhr, INF 324, Erdgeschoss
  Uebungsblatt 2 zur Optimierung (pdf)
  Uebungsblatt 2 zur Optimierung (doc)
  
  
• 12.2.04 Optimierung, König, Übungen Teil 3,
  im CIP-Pool der Mediziner, 9-13 Uhr, INF 324, Erdgeschoss
  
  
  

Scheinerwerb:

• Das Aufgabenblatt für den Scheinerwerb
  Aufgabenblatt (vollständig) (pdf)
  Aufgabenblatt (vollständig) (doc)
  
  Daten für Aufgabe 1:
  
  1. signalTrypto.tab
  2. bgdTrypto.tab
  
  
  
  
  
  
  

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Rainer Koenig- Last Change: Oct 2003